外泌体高通量测序——探究细胞交流的新模式

最近，外泌体测序成为了“临床人”的香饽饽。主要是因为这项技术适用疾病范围广、样本获取较为容易、很多应用思路仍处于尚未被挖掘的状态。

利用高通量测序技术，我们可以同时检测到外泌体中所含有的编码RNA（mRNA）以及非编码RNA（miRNA、lncRNA、circRNA）的表达信息，并利用生物学信息分析筛选出差异表达的RNA，进一步研究其在生物过程中的功能以及调控机制。

在这里小编还是要从头讲一下，外泌体是什么？

什么是外泌体？

外泌体(Exosome)是由细胞内多泡体与细胞膜结合后，释放到细胞外的一种直径约30-150nm的膜性囊泡，区别于微囊泡（100-1000nm)，凋亡小体（400-4000nm）。

图一 外泌体的形成

外泌体通过生物屏障，在细胞间传递功能性核酸分子，参与癌症、炎症、免疫、中枢神经系统功能、心脏细胞功能。在基本生物过程中起到作用或作为生物标志物，也可作为靶向递送生物分子药物载体（如治疗）的工具。

外泌体的功能也涉及广泛，包括细胞增值与凋亡调控，转移与侵袭，血管生成，免疫应答，细胞分化，代谢调控，微生物组调控，病毒感染……

经过初步了解，老师们是不是已经搓搓手开始准备样本了！

我们接受的样本多数为细胞上清、血清、血浆以及老师们分离好的外泌体样本。前三者会拿到实验室先进行外泌体分离，得到外泌体后，通常会对外泌体进行鉴定。鉴定方法为NTA粒径分析+电镜扫描。

图二 外泌体NTA鉴定报告

图三 外泌体电镜鉴定

接下来就可以开始提取外泌体RNA了。提取也分为两种，有关注miRNA的exo-small RNA-seq，也有可以包含到lncRNA、mRNA、circRNA的exo-lncRNA-seq。当然，在这一步中大多数人的选择都是“成年人我都要！“因为测序数据越多分析内容也会更为全面。通过生信手段得到差异基因，找到关注的富集通路，课题思路就会自己缓缓浮出水面。

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祝各位老师科研顺利！！！