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公司新闻/正文

数据挖掘做的好,多色高分跑不了!

509 人阅读发布时间:2023-03-02 15:51

讲到多色免疫组化实验结果,你的第一印象是什么样的?是不是一堆染的五颜六色无比炫酷的组织图像?就像下面这样:新闻图片1
多色免疫组化可不仅仅是多个抗体在组织切片上五彩缤纷的图像展示,上面不同标记的marker代表了不同细胞在组织中的数量和分布,这些细胞存在的多少和其相对的位置分布与疾病的发生和发展均有密切的关系,而探究这些关系的有力工具就是数据统计分析。数据统计分析在多色免疫组化结果中有多重要呢?来看看以下两个结果展示:
新闻图片2
(Wang T et al.,Molecular Therapy,2021,IF=12.91[1]
新闻图片3
(Wang LC et al., Clin Immunol. 2022,IF=10.19[2]

以上两篇文章均对多色免疫组化数据进行了多维度的数据分析,包括差异表达分析,生存预后分析,共表达相关性分析等,内容扎实,所以发到了10分以上的高分,总结起来就是一句话:数据挖掘做的好,多色高分跑不了!

 

针对数据分析模块,芯超组织病理平台与生信平台联合推出多色免疫荧光数据挖掘服务,让我们一起来详细了解一下吧。
 

 

mIHC可以获得哪些数据

 

在多重免疫组化的实验部分,我们不仅可以获得每种细胞表型的细胞数量,占比,密度等,还可以进一步对组织区域进行划分,如识别肿瘤实质和肿瘤间质,再分别得到实质和间质中每种细胞表型的细胞数量,占比,密度等数据。

 

除此之外,我们还可以进一步缩小分析范围,探究组织边缘附近一定范围内每种细胞表型的细胞数量,及特定细胞类型(如肿瘤细胞)附近一定范围内其他细胞类型的分布和数量。

 

通过对组织上各个维度进行细胞表型定量分析,我们就可以获得完整全面的细胞原位互作信息。

新闻图片4
组织芯片可以获得哪些信息
芯超组织芯片不仅包含上百点的组织样本,每例样本中还详细记录了患者的临床病理信息,包括患者年龄,性别,肿瘤大小,病理分级,T分期N分期TNM分期及患者生存信息等。
新闻图片5
(Wang LC et al., Clin Immunol. 2022)
在组织芯片上进行多色免疫组化实验,就可以得到以下的结果:
新闻图片6组织芯片mIHC多光谱扫描结果

芯超数据挖掘分析版块展示
结合mIHC获得的多维度定量数据和组织芯片附带的临床病例信息,我们就可以进行深度的数据挖掘,一起看看数据挖掘分析都能得到哪些结果吧!
1. 细胞表型分布  
新闻图片7

2. 细胞表型在每个样本中的分布  
新闻图片8
3. 各细胞表型表达差异分析  
新闻图片9
4. 各细胞表型与临床资料相关性分析 
新闻图片10

5. 生存预后分析
新闻图片116. 共表达相关性分析
新闻图片12

以上只是部分分析结果的展示,如果想查看完整分析报告的模板,也可以咨询芯超生物当地销售,或拨打全国统一热线400-720-0166 / 021-5132-0298。

 

参考文献:

1. Wang T, Zhang J, Li N, et al. Spatial distribution and functional analysis define the action pathway of Tim-3/Tim-3 ligands in tumor development. Mol Ther. 2022;30(3):1135-1148. doi:10.1016/j.ymthe.2021.11.015

2. Wang LC, Wang YL, He B, et al. Expression and clinical significance of VISTA, B7-H3, and PD-L1 in glioma. Clin Immunol. 2022;245:109178. doi:10.1016/j.clim.2022.109178

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